國內加護病房與社區抗藥性細菌比率不斷攀升，衛福部疾管署監測，從二○○六年至二○一六年，醫學中心加護病房常見八大超級細菌造成一萬五千多人感染，其中「碳青黴烯類抗藥性鮑氏不動桿菌（ＣＲＡＢ）」已動用最後一線抗生素，死亡率仍達百分之五到十五，醫師聞之色變，憂心未來無藥可醫。
今年流感疫情反常，北市一名國中生於五月先後罹患Ａ型流感及諾羅病毒，病情急轉直下，出現血尿後轉入加護病房插管急救，後因細菌感染引發急性敗血症導致多重器官衰竭，血液培養發現「抗甲氧苯青黴素金黃色葡萄球菌」（ＭＲＳＡ）」，發病到死亡僅三天。流感未必致命，但感染多重抗藥性細菌卻讓患者孱弱的身體更不堪一擊，造成致命危機。
五十歲壯年因急性心肌梗塞接受心臟血管繞道手術，不料在加護病房感染超級細菌，住院兩個月，用到最後一線抗生素仍無效，無法挽回生命，家屬很難接受，揚言提告。台大醫院小兒感染科主任黃立民指出，不只是手術，對於化療等患者，感染抗藥性細菌嚴重影響治療計畫，患者來不及治療因感染而喪命，不但可惜，更徒增醫療糾紛。
衛生署疾管局前局長、三總感染科主治醫師張峰義指出，超級細菌是全球都面臨的問題，國內醫學中心加護病房超級細菌十年來比率大增，原因複雜，包括人口老化使插管病人變多、疾病複雜度增加、感染管控在人力與物力方面的整合，醫療人員對於抗生素的使用管理也需要加強。
目前國內醫院抗藥性菌株監測由疾管署監測，社區抗生素抗藥性則由國衛院負責，張峰義認為，國內對於抗生素的管理與監測應有整體計畫，由於治療抗藥性細菌增加許多醫療成本，建議由掌握抗生素使用資訊的健保署負責統整，而感染管控需要消毒劑、乾洗手等物資，也需要第一線感控人員等專業人力，健保也應給予合理給付。
疾管署監測，台灣醫學中心加護病房超級菌比率十年來大增，ＭＲＳＡ於二○○六年時抗藥性達八成二，去年降至六成七，但除了ＭＲＳＡ抗藥性比率下降，其餘七種抗藥性皆往上增加，ＣＲＡＢ與ＶＲＥ.faecium萬古黴素抗藥性屎腸球菌抗藥性比率皆超過六成。
三總感染科主任林永崇表示，當病人感染ＣＲＡＢ或ＣＲＫＰ碳青黴烯類抗藥性肺炎克雷白氏菌而引發嚴重菌血症，死亡率達四到六成。
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